肺癌突变抗原T细胞捕获试剂盒

本产品用于捕获肺癌突变抗原结合的T细胞,该产品已经过流式检测、流式分选后TCR测序验证,确保每个突变均有结合的T细胞。本产品全称为DNA编码的肺癌突变蛋白MHC荧光复合物(简称LungCan-DfpMHC),包含肺癌54种突变抗原肽,抗原肽与HLA的复合物经过DNA编码修饰并偶联荧光素。使用价值是:

  1. 若配合使用流式分析仪,可以检测54种突变抗原特异性T细胞的数量。
  2. 若配合使用NGS DNA测序,可解析出54种常见突变抗原结合的T细胞数量。
  3. 若结合单细胞转录组测序和单细胞TCR测序,则可以立体式地分析出54种突变抗原的T细胞克隆型,以及每种突变抗原特异性T细胞的细分亚型和功能特性。

LungCan-DfpMHC产品价值在于,判断患者肺癌突变抗原是否被免疫细胞所识别,判断识别突变的免疫细胞数量,判断识别不同突变位点的免疫细胞克隆性增殖能力,判断识别不同突变的免疫细胞功能。

试剂盒主要成分

本产品主要由抗原肽和HLA形成多聚复合物组成,是多肽、HLA、DNA标签、荧光素的复合物。抗原肽来自于肺癌突变频率Top 100的突变位点表达蛋白,经过抗原特异性结合实验、HLA质谱、单细胞TCR测序等手段验证,最终筛选获得54种突变抗原肽HLA复合物,这54种突变可以被T细胞识别。

检测原理

本产品由54种抗原肽和HLA的复合物形成多聚体(简称:LungCan DfpMHC),高亲和力地结合T细胞表面的TCR(T细胞受体),同时复合物设计了随抗原肽不同的DNA标签序列和PE。本产品和T细胞共孵育后,LungCan DfpMHC通过TCR结合T细胞。

由于LungCan DfpMHC携带PE,所以流式检测可发现结合肺癌突变抗原特异性T细胞数量,流式分选可捕获肺癌突变抗原特异性T细胞用于进行功能测试、信号通路、克隆亚型分析。流式分选后的肺癌突变结合性T细胞混杂有多种类型,每种类型的T细胞结合不同突变蛋白。若需要进一步分析不同突变特异性T细胞的数量,通过抗原肽特异性DNA标签序列构建文库并测序,对测序的reads数量计数,将获得不同突变特异性T细胞的数量。结合有较强的与免疫细胞TCR的亲和力。

样本要求与使用方法

  1. 研究循环细胞中的肺癌突变抗原特异性T细胞,使用新鲜PBMC、冻存PBMC;
  2. 研究肿瘤浸润淋巴细胞的肺癌突变抗原特异性T细胞,使用新鲜肿瘤细胞悬液、冻存肿瘤细胞悬液。

检测结果样式

结果说明:每一列是单细胞TCR测序的一个样本,每一行代表单个突变抗原,颜色代表突变抗原特异性T细胞在样本中的含量。
结果说明:每一列是单细胞TCR测序的一个样本,每一行代表单个突变抗原,颜色代表突变抗原特异性T细胞在样本中的含量。

使用LungCan DfpMHC捕获6个患者的外周血PBMC,获得肺癌主要突变抗原结合的CD8+ T细胞。上图显示PD1抑制剂敏感组突变 ZNF692 8S>F、ZHX2 38P>L、SCML2 385P>L相对于对照(PD1抑制剂耐药组)的均有高水平的CD8+ T细胞结合。该数据是在T细胞被LungCan DfpMHC捕获后,通过NGS测序后,获得每种突变抗原DNA标签的reads数量,该Reads数量直接反映T细胞数量。

产品规格

25反应/试剂盒

50反应/试剂盒

参考文献

Bentzen, A. K. & Hadrup, S. R. Evolution of MHC-based technologies used for detection of antigen-responsive T cells. Cancer Immunol Immunother 66, 657–666 (2017).

Caushi, J. X. et al. Transcriptional programs of neoantigen-specific TIL in anti-PD-1-treated lung cancers. Nature 596, 126–132 (2021).

Castle, J.C., Uduman, M., Pabla, S., Stein, R.B., Buell, J.S., 2019. Mutation-Derived Neoantigens for Cancer Immunotherapy. Front Immunol 10, 1856.

Goodman, A.M., Kato, S., Bazhenova, L., Patel, S.P., Frampton, G.M., Miller, V., Stephens, P.J., Daniels, G.A., Kurzrock, R., 2017. Tumor Mutational Burden as an Independent Predictor of Response to Immunotherapy in Diverse Cancers. Mol Cancer Ther 16, 2598–2608.

Rizvi, N.A., Hellmann, M.D., Snyder, A., Kvistborg, P., Makarov, V., Havel, J.J., Lee, W., Yuan, J., Wong, P., Ho, T.S., Miller, M.L., Rekhtman, N., Moreira, A.L., Ibrahim, F., Bruggeman, C., Gasmi, B., Zappasodi, R., Maeda, Y., Sander, C., Garon, E.B., Merghoub, T., Wolchok, J.D., Schumacher, T.N., Chan, T.A., 2015. Mutational landscape determines sensitivity to PD-1 blockade in non–small cell lung cancer. Science 348, 124–128.

相关产品

相关解决方案

相关案例