肿瘤免疫治疗、新冠疫苗等影响生物医药的重大事件令细胞免疫成为研究热点。细胞免疫中特异性识别抗原的受体是TCR，即T细胞受体。就像体液免疫中的抗体可以特异性识别抗原一样，TCR同样具有特异性识别抗原的能力，这种能力是细胞免疫精准杀伤肿瘤细胞、病毒感染细胞的核心。
为什么要通过T细胞受体找抗原
随着TCR测序的成本越来越低，肿瘤治疗、感染免疫、自身免疫领域广泛使用TCR测序，以判断细胞免疫的激活特征，其中TCR就是免疫特征的标志。特别是疾病样本中具有共性的、大量重复扩增的TCR序列，这些TCR是细胞免疫响应主要抗原的标志。
虽然TCR容易检测，但是激活细胞免疫的抗原却不容易发现，为了发现细胞免疫抗原，研究者设想把TCR表达成蛋白后，通过相互作用方式找到对应的抗原。然而，由于TCR与抗原结合能力是抗体与抗原结合力的千分之一，使用类似于抗体-抗原结合方式无法通过TCR找到捕获到对应抗原。由于TCR-抗原结合的生物学特征，因此TCR对应抗原的发现工作是一直是艰巨而困难的。
原理
浩生医疗发布的AntigenScan数据库中，具有40万种TCR序列，其中TCR可以对应的抗原肽具有113万种，抗原肽和TCR结合的作用关系通过了3000篇文献验证。通过AntigenScan发现TCR靶向抗原的原理是：
- 输入TCR氨基酸序列；
- 通过局部序列比对，与AntigenScan数据库中的TCR CDR3序列比对；
- 数据库中若有CDR3相似性的TCR，进一步查询TCR对应文献的抗原肽；
- 若文献和抗原肽结果存在，则返回抗原肽序列、TCR CDR3匹配序列、文献编号、抗原肽刺激T细胞的实验验证方法。