TP53突变特异性T细胞捕获试剂盒

本产品用于捕获突变TP53蛋白抗原结合的T细胞,全称为DNA编码的TP53突变蛋白MHC荧光复合物(简称TP53-DfpMHC),本产品包含TP53 泛肿瘤最高频的32种突变抗原肽和HLA-A复合物,复合物经过DNA编码修饰并偶联荧光素。

高通量TP53突变特异性T细胞捕获试剂盒产品价值

判断患者TP53突变是否被免疫细胞所识别;

判断识别突变的免疫细胞数量;

判断识别不同突变位点的免疫细胞克隆性增殖能力;

判断识别不同突变的免疫细胞功能。

用途

本产品用于捕获突变TP53蛋白抗原结合的T细胞,全称为DNA编码的TP53突变蛋白MHC荧光复合物(简称TP53-DfpMHC),本产品包含TP53 泛肿瘤最高频的32种突变抗原肽和HLA-A复合物,复合物经过DNA编码修饰并偶联荧光素。

  1. 若配合使用流式分析仪,可以检测TP53突变抗原特异性T细胞的数量。
  2. 若配合使用NGS DNA测序,可解析出32种常见突变位点作为抗原结合的T细胞数量。
  3. 若结合单细胞转录组测序和单细胞TCR测序,则可以立体式地分析出32种突变的各突变抗原的T细胞克隆型,以及每种突变抗原特异性T细胞的细分亚型和功能特性。

TP53-DfpMHC产品价值在于,判断患者TP53突变是否被免疫细胞所识别,判断识别突变的免疫细胞数量,判断识别不同突变位点的免疫细胞克隆性增殖能力,判断识别不同突变的免疫细胞功能。

试剂盒主要成分

本产品主要由抗原肽和HLA-A形成多聚复合物。抗原肽来自于22个癌种汇总的10194标本中TP53 突变频率Top 32的突变位点表达蛋白。随抗原肽不同,抗原肽HLA复合物对应的DNA编码不同。所有复合物均偶联PE。

TP53-DfpMHC使用中国人泛癌基因组测序计划获得的10194位患者的测序数据分析,覆盖32个突变位点,这些突变覆盖22个癌种。32种突变在各癌种的发生频率如下:

TP53突变分布的肿瘤类型
TP53突变分布的肿瘤类型
左图的表格数据

检测原理

本产品由32种抗原肽和HLA-A的复合物形成多聚体(简称:TP53 DfpMHC),高亲和力地结合T细胞表面的TCR(T细胞受体),同时复合物设计了随抗原肽不同的DNA标签序列和PE。本产品和T细胞共孵育后,TP53 DfpMHC通过TCR结合T细胞。

由于TP53 DfpMHC携带PE,所以流式检测可以确认结合TP53突变蛋白的所有T细胞数量,流式分选可捕获TP53突变蛋白的所有T细胞。

分选后的TP53突变蛋白结合性T细胞混杂有多种类型,每种类型的T细胞结合不同的TP53突变蛋白。若需要进一步分析不同突变特异性T细胞的数量,通过基于抗原肽特异性DNA标签序列的文库构建并测序,对测序的reads数量计数,将获得不同突变特异性T细胞的数量。结合有较强的与免疫细胞TCR的亲和力。

样本要求与使用方法

研究循环细胞中的TP53突变抗原特异性T细胞,使用新鲜PBMC、冻存PBMC;

研究肿瘤浸润淋巴细胞的TP53突变抗原特异性T细胞,使用新鲜肿瘤细胞悬液、冻存肿瘤细胞悬液。

检测结果样式

流式检测结果

使用高通量TP53突变肽MHC多聚体做流式检测结果
图片说明:使用高通量TP53突变肽MHC多聚体做流式检测结果

使用使用PE和APC同时标记TP53突变抗原特异性T细胞,患者组捕获的阳性细胞多于对照志愿者细胞数。

测序结果

图片说明:每行代表一种TP53突变,每列代表每个患者,颜色代表突变抗原特异性T细胞在每个患者中的含量

使用TP53 DfpMHC捕获6个患者的外周血PBMC,获得TP53主要突变抗原结合的CD8+ T细胞。上图显示肺癌测试组患者TP53突变R175H、R249S、R273H相对于对照(其他肿瘤表型)的均有高水平的CD8+ T细胞结合。该数据是在T细胞被TP53 DfpMHC捕获后,通过NGS测序后,获得每种突变抗原DNA标签的reads数量,该Reads数量直接反映T细胞数量。

产品规格

25反应/试剂盒

50反应/试剂盒

参考文献

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