TCR测序样本重复的意义

随着肿瘤免疫、病毒免疫研究的增加,T细胞受体作为免疫效应的主要识别物,其多样性检测的场景越来越多。只要有测量,就会考虑重复检测样本的意义。TCR免疫组库数据在面临多个标本重复检测时,究竟会有多少TCR链具有样本间的一致性?只有回答了这个问题,才能正确地理解TCR测序时样本重复的意义。

为了回答这个问题,就需要对健康人的TCR免疫组库克隆类型的样本间共性做出描绘。2021年Cell Report 中“High Frequency of Shared Clonotypes in Human T Cell Receptor Repertoires”一文中获得结论,TCR链的序列特异性在样本间的共性很低,三个健康人之间共性的TCRbeta链有8%,其中,有数CD8+T细胞共享的TCRbeta克隆更为稀少,约为静息 CD8+T细胞为3.5%,记忆CD8+T细胞为0.4%。而CD4+T细胞共享TCRbeta克隆特征为,静息状态下为5%和2.3%。

值得注意的是,在健康人之间,即便如此低比例的TCRbeta链是一致的,健康人间一致性TCRbeta链的总数也达到了49万种,每增加一个样本共性TCR克隆范围缩小0.3个数量级。

从上述研究结论中可以看出,如果为了缩小肿瘤免疫或病毒免疫T细胞的共性TCR范围,仍然需要增加样本数量,具体缩小范围的样本数量。

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